Научно-исследовательская работа коллектива ИнЭТиП организована в рамках двух основных научных направлений:
«Разработка, моделирование и анализ новых устройств и методов в области микро- и наноэлектроники, мехатронных, радиоэлектронных, информационно-телекоммуникационных, биофизических и управляющих систем»;
«Разработка прогрессивных технологий физико-технической и механической обработки конструкционных материалов различного назначения и повышение эффективности технологических процессов изготовления изделий машино- и приборостроения».
Каждая кафедра исторически обладает конкретным научным направлением и выполняет ряд проектов в рамках выигранных учеными ИнЭТиП грантов Министерства образования и науки РФ и различных научных фондов.